1、机构扁平化。大型建筑企业集团内部往往存在二级、三级、四级子公司或分公司，集团承包下来的工程经过层层分包最终由低等级的子公司或分公司实际进行施工。

营业税制下的税收征管较为松散，增值税“以票控税、链条抵扣”的征管模式是非常严格的，每个环节均需严格按照进销项税额相抵的规定征收增值税，大型建筑企业集团内部组织架构的复杂性导致管理链条延长、流转环节增多，潜在的税务风险增大，可能造成工程项目的增值税进销项税额不相匹配。因此，建筑企业集团应结合自身经营特点，改变企业集团多级法人、内部层层分包的组织架构，压缩管理层级、缩短管理链条，将组织机构扁平化处理，降低涉税风险。

2、分工专业化。大型建筑企业集团可将自身业务经营中较为专业的项目拆分出来，建立专业的子公司以运作处理相应的项目，独立办理营业执照和税务登记，进行独立会计核算、独立纳税申报。

比如，为了解决集团内从外部租入设备的问题，可以探讨在一定区域内设立专业的设备租赁子公司；针对甲供材料行为，企业集团可以将自己的材料采购部门独立出来，成立专业的材料供应子公司，并寻求与甲方的合作。

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